O papel do Laboratório de Microbiologia na Prevenção e Controlo das Infeções associadas aos Cuidados de Saúde

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1 O papel do Laboratório de Microbiologia na Prevenção e Controlo das Infeções associadas aos Cuidados de Saúde Sandra Paulo Laboratório de Microbiologia Serviço de Patologia Clínica - CHCB

2 Infeções associadas aos cuidados de Saúde Morbilidade e mortalidade associadas Tempo de internamento Custos Controlo: esforço interdisciplinar Serviço de Patologia Clínica GCL PPCIRA Serviços clínicos Logística: limpeza e esterilização Direção clínica Laboratório de Microbiologia - Prevenção e Controlo das Infeções associadas aos Cuidados de Saúde

3 Laboratório de Microbiologia Prevenção e Controlo das Infeções associadas aos Cuidados de Saúde 1. Resultados laboratoriais 2. Estudos de colonização 3. Comunicação de resultados 4. Análise - taxas de infeção hospitalar 5. Doenças de declaração obrigatória 6. Participação nos programas de vigilância epidemiológica 7. Colaboração com o PPCIRA

4 1. Resultados laboratoriais Manual de colheitas Procedimentos de colheita Amostra prévia ao inicio da antibioterapia Qualidade da amostra / Critérios de rejeição Microrganismos identificados - disponibilizados Interpretação TSA - significado clínico Critérios EUCAST (European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing) Resultados rápidos e fidedignos Laboratório de Microbiologia - Prevenção e Controlo das Infeções associadas aos Cuidados de Saúde

5 1. Resultados laboratoriais Técnicas: Elevada sensibilidade e especificidade Simples / sempre disponíveis Manuais / Automatizadas Laboratório de Microbiologia - Prevenção e Controlo das Infeções associadas aos Cuidados de Saúde

6 1. Resultados laboratoriais Controlo de qualidade: Avaliação externa de qualidade Controlo de qualidade interno Laboratório de Microbiologia - Prevenção e Controlo das Infeções associadas aos Cuidados de Saúde

7 1. Resultados laboratoriais Alteração do modelo organizacional do Laboratório : Testes rápidos Identificação microbiológica sem cultura prévia PCR MALDI-TOF Cultura antibiograma Laboratório de Microbiologia - Prevenção e Controlo das Infeções associadas aos Cuidados de Saúde

8 2. Estudos de colonização MRSA Notificação ( em 48 horas) GCLPPCIRA Médicos assistentes Acinetobacter baumannii Laboratório de Microbiologia - Prevenção e Controlo das Infeções associadas aos Cuidados de Saúde

9 2. Estudos de colonização MRSA Cultura Cultura PCR multiplex meio cromogénico Zaragatoa nasal 24-48h 60 min

10 2. Estudos de colonização Pesquisa MRSA CHCB 2014 (Exsudado nasal): 163 amostras, 37 positivas para MRSA. Positivos 23% Negativos 77% Laboratório de Microbiologia - Prevenção e Controlo das Infeções associadas aos Cuidados de Saúde

11 3. Comunicação de resultados Informação clínica relevante Diagnóstico Tratamento Serviços Clínicos Comunicação DGS Direção clinica Direção enfermagem PPCIRA Colheitas Transporte de amostras Processamento laboratorial Relatórios Laboratório Laboratório de Microbiologia - Prevenção e Controlo das Infeções associadas aos Cuidados de Saúde

12 3. Comunicação de resultados Informação clínica relevante Diagnóstico Tratamento Comunicação Colheitas Transporte de amostras Processamento laboratorial -Aconselhamento sobre: - colheitas - transporte das amostras. Relatórios - Ações de formação dirigidas aos Serviços clínicos. Laboratório de Microbiologia - Prevenção e Controlo das Infeções associadas aos Cuidados de Saúde

13 3. Comunicação de resultados - Relatórios Escaras

14 3. Comunicação de resultados - Relatórios Pús Laboratório de Microbiologia - Prevenção e Controlo das Infeções associadas aos Cuidados de Saúde

15 3. Comunicação de resultados - Relatórios Secreções brônquicas Laboratório de Microbiologia - Prevenção e Controlo das Infeções associadas aos Cuidados de Saúde

16 3. Comunicação de resultados - Relatórios Resistências aos antimicrobianos

17 3. Comunicação de resultados - Relatórios Resistências aos antimicrobianos

18 3. Comunicação de resultados - Relatórios Resistências aos antimicrobianos

19 4. Análise periódica das Taxas de Infeção Hospitalar % microrganismos isolados % microrganismos multiresistentes % resistência aos antimicrobianos Monitorização alterações nos padrões de resistência Terapêutica empírica Laboratório de Microbiologia - Prevenção e Controlo das Infeções associadas aos Cuidados de Saúde

20 Microrganismos mais frequentemente isolados Padrão de resistência aos agentes antimicrobianos Laboratório de Microbiologia Centro Hospitalar Cova da Beira Janeiro a Dezembro amostras - exames culturais 4458 culturas positivas (22%) Laboratório de Microbiologia - Prevenção e Controlo das Infeções associadas aos Cuidados de Saúde

21 Uroculturas 6625 Bactérias 1556 Fungos 138 Parasitas (Trichomonas vaginalis) Bactérias 23% Micológico 2% Parasitas 0,1% 4 Negativas 75% Escherichia coli 63,8 Klebsiella pneumoniae 11,3 ssp pneumoniae Proteus mirabilis 6,7 Enterococcus faecalis 5,5 Pseudomonas aeruginosa 4,8 Staphylococcus aureus 3,3 Acinetobacter baumannii 2,2 Enterococcus faecium 1,8 Outros 0,6 %

22 Coproculturas 431 (404 negativas / 34 positivas) Pseudomonas aeruginosa (10) 29% Salmonella spp (7) 21% Aeromonas hydrophila (3) 9% Yersinia enterocolitica (1) 3% Campylobacter spp (13) 38% Pesquisa de vírus nas fezes Pesquisa de Rotavirus e Adenovirus amostras Pesquisa de Norovírus - 51 amostras 96% 95% 85% 4% 5% 15% Norovirus Adenovirus Rotavirus

23 7622 frascos (6044 negativos / 1578 positivos) 1696 Isolamentos % Hemoculturas Negativas 78.8% fungos 0,4% Bactérias 20,8% Staphylococcus coagulase negativo 23,0 (outros) Staphylococcus epidermidis 15,8 Escherichia coli 14,0 Staphylococcus aureus 13,9 Staphylococcus hominis spp hominis 8,7 Klebsiella pneumoniae ssp 4,0 pneumoniae Enterococcus faecium 3,7 Streptococcus pneumoniae 2,7 Streptococcus do grupo viridans 2,1 Pseudomonas aeruginosa 1,7 Acinetobacter baumannii 0,8 Serratia marcescens 0,7 Hafnia alvei 0,6 Proteus mirabilis 0,5 Clostridium perfringens 0,5 Streptococcus agalactiae 0,5 Outros 6,8

24 Secreções brônquicas 1681 amostras 761: solicitada nova colheita amostras salivares, amostras não produtivas outro tipo de contaminação Amostras processada: Flora Saprófita Habitual : positivas 110 negativas e Positivas 22% Negativas 7% Amostras não processadas 45% 424 isolamentos % Staphylococcus aureus 24,1 Pseudomonas aeruginosa 15,3 Klebsiella pneumoniae ssp pneumoniae 14,2 Acinetobacter baumannii 13,5 Streptococcus pneumoniae 5,9 Haemophilus influenza 5,7 Stenotrophomonas maltophilia 5,0 Escherichia coli 3,1 Enterobacter cloacae spp cloacae 2,6 Proteus mirabilis 1,2 Serratia marcescens 0,9 Burkholderia cepacia 0,7 Sphingomonas(Pseudomonas) 0,7 paucimobilis Enterobacter aerogenes 0,7 Morganella morganni ssp morganni 0,7 Providencia stuartii 0,7 Outros 5,0 FSH 26%

25 Staphylococcus spp Padrão de resistência aos agentes antimicrobianos Foram estudadas 629 estirpes do género Staphylococcus sendo o S. aureus o mais isolado (356 estirpes). S hominis/hominis 10% S. epidermidis 24% Outros SCN. 9% S. aureus 57% % Resistência S. aureus Vancomicina 0 Teicoplanina 0 Linezolid 0,3 Daptomicina 0,8 Levofloxacina 67 MRSA Gentamicina 0,84 Eritromicina 59 Trimetroprim/sulfametoxazol 0 Clindamicina 59 Tigeciclina 0

26 Enterococcus spp Padrão de resistência aos agentes antimicrobianos E. Faecium (84) 36% Outros Enterococcus (8) 3% E. Faecalis (143) 61% E. faecalis % E. Faecium % Ampicilina 1,4 95 Gentamicina Levofloxacina Eritromicina 60,7 95,2 Nitrofurantoina 0,7 - Vancomicina 0,7 21 Linezolid 0,7 2,4 Teicoplanina 0,7 18 Tigeciclina 0 0

27 Bacilos Gram negativos E. Coli % K. pneumoniae % Klebsiella pneumoniae (265) 16% Padrão de resistência aos agentes antimicrobianos Proteus mirabilis (121) 7% 1646 antibiogramas Enterobacter cloacae 2% Morganella morganni 2% 0utras Enterobacterias 7% E.coli (1093) 71% Ampicilina Amox/ clavulânico ,1 Piperacilina/ 9,4 28,3 Tazobactan Cefalotina 14,5 35,7 Cefuroxima 18, Cefotaxima 11,7 29,9 Ertapenem 0,1 2,7 Meropenem 0,1 1,5 Gentamicina 8,6 25,7 Tobramicina 13,1 27,1 Amicacina 0,7 0 Ciprofloxacina Levofloxacina 29,9 33,2 Cotrimoxazol 32,8 26 Nitrofurantoína 2,5 32,5

28 Enterobactereaceas Padrão de resistência aos agentes antimicrobianos Observou-se um aumento de estirpes multiresistentes nomeadamente pela produção de ESBL e Carbapenemases. Produção de ESBL: E. coli: 8,5% das estirpes isoladas produziram ESBL. Klebsiella pneumoniae: 27,3% das estirpes isoladas são produtoras de ESBL, e a maioria delas com impermeabilidade às cefamicinas. E. coli 8,5% Klebsiella pneumoniae 27,3%

29 Pseudomonas aeruginosa Padrão de resistência aos agentes antimicrobianos 200 isolamentos % Resistência Piperacilina 32,8 Piperacilina/Tazobactam 32,6 Cefotaxima 100 Ceftazidima 19 Cefepime 22 Ciprofloxacina 34 Levofloxacina 42 Gentamicina 17 Tobramicina 13 Amikacina 12 Imipenem 5,1 Meropenem 7,9 Aztreonam 17 Colistina 1,0

30 Acinetobacter baumannii Padrão de resistência aos agentes antimicrobianos 99 isolamentos % resistência Piperacilina/Tazobactam 86 Cefotaxima 100 Ceftazidima 87,9 Gentamicina 69 Tobramicina 68 Amikacina 16 Ciprofloxacina 88 Levofloxacina 86 Meropenem 88 Imipenem 96 Trimetoprim/Sulfametoxazol 71 Colistina 0 Nitrofurantoina 100

31 5. Doenças de declaração obrigatória Declaração clínica: Sistema Nacional de Vigilância Epidemiológica

32 5. Doenças de declaração obrigatória Declaração laboratorial: Brucelose Campilobacteriose Criptosporidiose Lepra D. Invasiva Pneumocócica Infeção E. coli O157 Listeriose Salmoneloses não Typhi/Paratyphi Shigelose Sifílis VIH / SIDA Malária Febre Escaro-Nodular (Rickettsiose) Cólera Febre Q D.Invasiva Haemophilus Tuberculose D. Legionários influenzae D. Invasiva Meningocócica Yersiniose Gripe não Sazonal Febre Tifoide e Paratifoide Giardiase Rubéola Toxoplasmose Congénita Hepatite A Hepatite B Gonorreia Infeção Chlamydia trachomatis Hepatite C

33 6. Programas de vigilância epidemiológica Rede Nacional de Vigilância Laboratorial da Resistência aos Antibióticos - registo obrigatório A notificação é obrigatória e realizada por via eletrónica rnvlra@insa.minsaude.pt, enviada em simultâneo para o INSA e DGS. No CHCB enviamos as culturas de microrganismos MDR para um centro de investigação com quem temos um protocolo de colaboração.

34 Microrganismos alerta Notificação imediata (48 horas) Todos os tipos de amostras Exames: diagnóstico etiológico da infeção estudo de colonização avaliação ambiental em instituições de saúde Laboratório de Microbiologia - Prevenção e Controlo das Infeções associadas aos Cuidados de Saúde

35 Microrganismos alerta Padrão de resistência ou resistência intermédia aos antimicrobianos pouco habitual ou de baixa prevalência na Unidade de Saúde e que, por esta razão, implica implementar medidas urgentes para a sua contenção. Critérios: EUCAST Staphylococcus aureus com resistência intermédia (VISA) ou resistentes à vancomicina Staphylococcus aureus com resistência intermédia ou resistência ao linezolide Staphylococcus aureus e Enterococcus spp. com resistência intermédia ou resistência à daptomicina Enterococcus faecium e Enterococcus faecalis com resistência intermédia ou resistência à vancomicina em, e apenas em, Unidades de Saúde em que o rácio deste tipo de Enterococcus sobre o total de Enterococcus isolados seja inferior a 0,05 Enterobacteriaceae com resistência intermédia ou resistência aos carbapenemes e/ou presumíveis produtoras de carbapenemases Pseudomonas aeruginosa com resistência intermédia ou resistência a, pelo menos, um dos agentes antimicrobianos em todas as categorias, exceto duas ou menos (isto é, suscetível a antimicrobianos de não mais de duas categorias) em, e apenas em, unidades de saúde em que o rácio deste tipo de Pseudomonas aeruginosa sobre o total de Pseudomonas aeruginosa isoladas seja inferior a 0,05 Acinetobacter spp. não suscetível a pelo menos um dos agentes antimicrobianos em todas as categorias, exceto uma ou menos (isto é, suscetível a antimicrobianos de não mais de uma categoria) em, e apenas em, unidades de saúde em que o rácio deste tipo de Acinetobacter spp. sobre o total de Acinetobacter spp. isoladas seja inferior a 0,05

36 Microrganismos problema Notificação trimestral Todos são notificados, independentemente da sua suscetibilidade aos antimicrobianos Causam frequentemente doença e com taxas de resistência epidemiologicamente significativa envio: a indicar pelo INSA Laboratório de Microbiologia - Prevenção e Controlo das Infeções associadas aos Cuidados de Saúde

37 Microrganismos problema Origem invasiva (Sangue e LCR): Pseudomonas aeruginosa Acinetobacter spp. Enterobacteriaceae Staphylococcus aureus Enterococcus faecalis e Enterococcus faecium Streptococcus pneumoniae Outra origem: Clostridium difficile Laboratório de Microbiologia - Prevenção e Controlo das Infeções associadas aos Cuidados de Saúde

38 7. Colaboração com o PPCIRA Protocolos inadequados de antibioterapia: aumento das resistências bactérias multirresistentes Protocolos de antibioterapia empírica adequados à Instituição de saúde Antibiograma com significado clínico Participação ativa no GCL PPCIRA Laboratório de Microbiologia - Prevenção e Controlo das Infeções associadas aos Cuidados de Saúde

39 Sandra Paulo Laboratório de Microbiologia Serviço de Patologia Clínica - CHCB