Plano de Ensino. Qualificação/link para o Currículo Lattes: Teoria Exercício Laboratório 45 15

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1 Plano de Ensino Universidade Federal do Espírito Santo Campus: Alegre Curso: Ciências Biológicas Departamento Responsável: Biologia Data de Aprovação (Art. nº 91): Docente responsável: Marcia Flores da Silva Ferreira Qualificação/link para o Currículo Lattes: Disciplina: Biotecnologia Pré-requisito: Biologia Molecular Código: DBI Carga Horária Semestral: 60 Distribuição da Carga Horária Semestral Créditos: 4 Teoria Exercício Laboratório Ementa: Histórico da biotecnologia. Fundamentos da biotecnologia. Biologia molecular e genes de interesse. Mapeamento genético. Organismos geneticamente modificados. Expressão de genes eucarióticos em bactérias, animais e plantas transgênicas. Identificação de paternidade. Diagnóstico genético e bioética. Segurança do uso de organismos transgênicos. A Biotecnologia e o melhoramento genético. Objetivos específicos: 1) Conceituar biotecnologia 2) Entender técnicas relacionadas aas análises estruturais e funcionais de genomas, de análise de expressão gênica e de estudos de polimorfismos; 3) Entender estudos de manipulação do material genético; 4) Conhecer exemplos práticos de aplicações biotecnologias aplicados ao melhoramento e a organismos geneticamente modificados

2 Conteúdo Programático (indicar as unidades e/ou tópicos de conteúdos organizados para colocar em prática os conceitos, habilidades e/ou competências definidos na ementa e melhor explicitados nos objetivos específicos) Aulas 1 a 20 Introdução a disciplina, marcadores moleculares técnicas e aplicações na biologia, agronomia e saúde; análises forenses; diagnóstico molecular; análise de dados, exercícios. Aulas 21 a 40 NGS, Genomas estruturais; bioinformática, práticas e exercícios e avaliação 2. Aulas 41 a 60 clonagem molecular, aplicações, transcriptômica, proteômica, exercícios e avaliação 3. Metodologia (explicitar a forma de desenvolvimento da disciplina, os recursos utilizados) Aulas expositivas, exercícios práticos, visitas a laboratórios, uso de artigos utilizados de exemplos na área de biotecnologia.

3 Critérios/Processo de avaliação da Aprendizagem (indicar a concepção de avaliação adotada, os instrumentos a serem utilizados, as formas de avaliar, os critérios de correção, os pesos conferidos a cada instrumento) Avaliações: - 3 Provas Teóricas totalizando 80% - 1 Seminário 10% da nota final - Exercícios 10% A nota final (NF) será feita com uma média ponderada pelo peso de cada nota. Para os alunos que não atingirem a nota média mínima (7,0) será aplicada uma prova final que abordará todo o conteúdo programático da disciplina trabalhado durante o semestre letivo. Bibliografia básica (indicar um mínimo de três obras disponíveis na biblioteca e que deem conta de todo o conteúdo programático a ser desenvolvido) 1) ALBERTS, B.; JOHNSON, A.; LEWIS, J.; RAFF, M.; ROBERTS, K.; WALTER, P. Biologia molecular da célula. 4.ed. (tradução). Porto Alegre: Artmed Editora, p. 2) FERREIRA, M.E.; GRATTAPAGLIA, D. Introdução ao uso de marcadores moleculares em análise genética. Embrapa ) LEWIN, B. Genes VII. 7ª edição. Artmed Editora, ) LODISH, H. Biologia Celular e Molecular. 5ª edição. Artmed Editora, ) ZAHA, A. Biologia Molecular Básica. 3ª edição. Porto Alegre: Mercado Aberto, ) DECRETO Nº 6.041, DE 8 DE FEVEREIRO DE Política de Desenvolvimento da Biotecnologia, 7) Faleiro, FG; Andrade, SRM. Biotecnologia: estado da arte e aplicações na agropecuária Planaltina, DF : Embrapa Cerrados, p. (DISPONÍVEL ON LINE)

4 Bibliografia complementar (indicar um mínimo de cinco obras disponíveis na biblioteca e que deem conta de complementar e oferecer oportunidades de aprofundamento de todo o conteúdo programático a ser desenvolvido) MIR, L. Genômica. CIB: Atheneu, p. BORÉM,A.; SANTOS, F.R. Biotecnologia simplificada. Viçosa:Suprema, p. BARKER, K. Na bancada. Manual de iniciação científica em laboratórios de pesquisas biomédicas. 1ª edição. Artmed Editora, VERLING, R.; CURI, R.; BEVILACQUA, E.; NEWSHOLME, P. Análises de RNA, proteínas e metabólitos, metodologia e procedimentos técnicos; Editora Santos, Cronograma

5 Aula TEMAS REFERÊNCIAS 31/03 Apresentação da disciplina 06/04 Conceito de biotecnologia DECRETO Nº 6.041, DE 8 DE FEVEREIRO DE Política de Desenvolvimento da Biotecnologia, 07/04 Visitas biotecnológicas Prática 1 Laboratórios de biotecnologia da instituição 1) Relatório 13/04 Identificação e Purificação de produtos biotecnológicos 20/04 Marcadores Moleculares baseados em DNA introdução RAPD, AFLP, ISSR 27/04 Marcadores SSR, análises de agrupamento e distâncias genéticas SNPs 28/04 Análises Forenses e teste de paternidade diagnóstico 04/05 Aplicações no melhoramento 05/05 Apresentação de artigos 11/05 12/05 Prova 1 18 e 19/05 Métodos de sequenciamento; PCR, diferentes métodos; Plataformas; Vantagens e desvantagens de cada plataforma; Keywords: Reads, alinhamento, Montagem, Cromatografia HPLC Leitura complementar Ana 1) FERREIRA, ME.; GRATTAPAGLIA, D. Introdução ao uso de marcadores moleculares em análise genética. 3. ed. - Brasília, DF: EMBRAPA, p. 2) Faleiro et al, ) FERREIRA, ME.; GRATTAPAGLIA, D. Introdução ao uso de marcadores moleculares em análise genética. 3. ed. - Brasília, DF: EMBRAPA, p. 2) Faleiro et al, 2011 Prática 2 cálculos Leitura recomendada: cap 7 livro Faleiro Artigo: DNA forense. Dolinsky et al., 2012 (on line) Carvalho, MCCG; Silva, DCG. Sequenciamento de DNA de nova geração e suas aplicações na genômica de plantas. Ciência Rural, v.40, n.3, p , mar, 2010.Disponível on line

6 25 e 26/05 Bancos de dados Prática de Blast Prática 3 01 e 02 /06 Prática 4 - Alinhamento de sequências Prática 5 Desenho de primers 08/06 Discussão de artigos 2 Cap 17 - Zaha et al Biologia Molecular Básica Bioinformática na Análise de Genes e Genomas Cap 06_CURSO ON LINE - INTRODUÇÃO À BIOINFORMÁTICA - Prof. Dr. Francisco Prosdocimi 2007 Cap 17 - Zaha et al Biologia Molecular Básica Bioinformática na Análise de Genes e Genomas Cap 06_CURSO ON LINE - INTRODUÇÃO À BIOINFORMÁTICA - Prof. Dr. Francisco Prosdocimi /06 Clonagem 1 Zaha et al Biologia Molecular Básica. Cap 22/06 Prova 2 23/06 Clonagem 2 Bibliotecas genômicas e de cdna Clonagem Gateway 29/03 Organismos geneticamente modificados Zaha et al Biologia Molecular Básica. Cap Zaha et al Biologia Molecular Básica. Cap 30/06 Westhern, Southern, Northen Zaha et al Biologia Molecular Básica. Cap 06/07 Discussão de artigos 2 07/07 Análise de expressão real time 13/07 Análise de expressão aplicações real time 14/07 Análise de expressão microarranjo e RNA -seq 20/07 Análise de proteômica 21/07 Artigos 3 27/07 Revisão 28/07 Prova 3 03/08 Prova Final